无菌室可以营造出无菌的空间，这样适合对微生物等进行科研。所以，无菌室可以适应的领域有很多，比如在医药卫生，生物工程方面，需要无菌操作。而其他领域需要无菌无尘环境，也可以使用，比如精密制造，航天航空领域。而有些领域需要在密闭环境中工作，比如汽车喷涂等，都是需要无菌室的配合操作的。
无菌室的工作室高度可以相对低一些，这样也便于清理顶部，保障无菌室的干净卫生。为了防止细菌灰尘沉积，内部的设计必须保持平整光滑性，这样就无处可存了，也更便于清理。并且要保证无菌室的顶部，侧面，底部都不透水，防止内部潮湿。所以一定要注意防水防潮性。
为了便于操作，无菌室的室内光线必须要好，这样即使在室外，也能清楚的看见内部情况，便于管理。平时工作人员进出无菌室，都会带来一些气流和灰尘，所以无菌室不能直接与外界相接，中间应该设有通道和多个小房间，通道可以小一些，但是必须要有。这样就能让无菌室更加干净。同时无菌室与通道之间，也要安装门，防止走廊的气流进入无菌室。
可见，无菌室的主要要求就是减少细菌灰尘进入的可能性，即使是小小的气流，如果没处理好，可能也会影响到检测结果。所以应该严格按照要求选择无菌室，以免达不到无菌的效果。
